ਨੈਟ ਮੇਡ | ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਟਿਊਮਰ ਦੀ ਮੈਪਿੰਗ ਲਈ ਇੱਕ ਮਲਟੀ-ਓਮਿਕਸ ਪਹੁੰਚ

ਨੈਟ ਮੇਡ | ਕੋਲੋਰੈਕਟਲ ਕੈਂਸਰ ਦੇ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਟਿਊਮਰ, ਇਮਿਊਨ ਅਤੇ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਲੈਂਡਸਕੇਪ ਨੂੰ ਮੈਪ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਮਲਟੀ-ਓਮਿਕਸ ਪਹੁੰਚ ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਦੇ ਨਾਲ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਦੇ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ
ਹਾਲਾਂਕਿ ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ ਲਈ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰਾਂ ਦਾ ਹਾਲ ਹੀ ਦੇ ਸਾਲਾਂ ਵਿੱਚ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਅਧਿਐਨ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ, ਮੌਜੂਦਾ ਕਲੀਨਿਕਲ ਦਿਸ਼ਾ-ਨਿਰਦੇਸ਼ ਸਿਰਫ ਟਿਊਮਰ-ਲਿੰਫ ਨੋਡ-ਮੈਟਾਸਟੇਸਿਸ ਸਟੇਜਿੰਗ ਅਤੇ ਡੀਐਨਏ ਬੇਮੇਲ ਰਿਪੇਅਰ (ਐਮਐਮਆਰ) ਨੁਕਸ ਜਾਂ ਮਾਈਕ੍ਰੋਸੈਟੇਲਾਈਟ ਅਸਥਿਰਤਾ (ਐਮਐਸਆਈ) (ਸਟੈਂਡਰਡ ਪੈਥੋਲੋਜੀ ਟੈਸਟਿੰਗ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ) 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਇਲਾਜ ਦੀਆਂ ਸਿਫ਼ਾਰਸ਼ਾਂ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਨ ਲਈ. ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੇ ਕੈਂਸਰ ਜੀਨੋਮ ਐਟਲਸ (ਟੀਸੀਜੀਏ) ਕੋਲੋਰੇਕਟਲ ਕੈਂਸਰ ਸਮੂਹ ਅਤੇ ਮਰੀਜ਼ ਦੇ ਬਚਾਅ ਵਿੱਚ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ-ਅਧਾਰਿਤ ਇਮਿਊਨ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆਵਾਂ, ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਾਂ ਅਤੇ ਟਿਊਮਰ ਸਟ੍ਰੋਮਾ ਵਿਚਕਾਰ ਸਬੰਧ ਦੀ ਕਮੀ ਨੂੰ ਨੋਟ ਕੀਤਾ ਹੈ।

ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਖੋਜ ਅੱਗੇ ਵਧੀ ਹੈ, ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਕੋਲੋਰੇਕਟਲ ਕੈਂਸਰ ਦੀਆਂ ਗਿਣਾਤਮਕ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ, ਕੈਂਸਰ ਸੈਲੂਲਰ, ਇਮਿਊਨ, ਸਟ੍ਰੋਮਲ, ਜਾਂ ਕੈਂਸਰ ਦੀ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਪ੍ਰਕਿਰਤੀ ਸਮੇਤ, ਕਲੀਨਿਕਲ ਨਤੀਜਿਆਂ ਨਾਲ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਬੰਧਿਤ ਹੋਣ ਦੀ ਰਿਪੋਰਟ ਕੀਤੀ ਗਈ ਹੈ, ਪਰ ਅਜੇ ਵੀ ਇਸ ਗੱਲ ਦੀ ਸੀਮਤ ਸਮਝ ਹੈ ਕਿ ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਮਰੀਜ਼ ਦੇ ਨਤੀਜਿਆਂ ਨੂੰ ਕਿਵੇਂ ਪ੍ਰਭਾਵਿਤ ਕਰਦੇ ਹਨ। .
ਫੀਨੋਟਾਈਪਿਕ ਜਟਿਲਤਾ ਅਤੇ ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਸਬੰਧਾਂ ਨੂੰ ਤੋੜਨ ਲਈ, ਕਤਰ ਵਿੱਚ ਸਿਡਰਾ ਇੰਸਟੀਚਿਊਟ ਆਫ਼ ਮੈਡੀਕਲ ਰਿਸਰਚ ਦੇ ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਦੀ ਇੱਕ ਟੀਮ ਨੇ ਹਾਲ ਹੀ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਸਕੋਰ (ਮਾਈਕਰੋਸਕੋਰ) ਵਿਕਸਤ ਕੀਤਾ ਅਤੇ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕੀਤਾ ਜੋ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਅਤੇ ਇਮਿਊਨ ਅਸਵੀਕਾਰਨ ਨੂੰ ਜੋੜ ਕੇ ਵਧੀਆ ਬਚਾਅ ਦਰਾਂ ਵਾਲੇ ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਦੇ ਇੱਕ ਸਮੂਹ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਸਥਿਰ (ICR)। ਟੀਮ ਨੇ ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਕੋਲੋਰੇਕਟਲ ਕੈਂਸਰ ਵਾਲੇ 348 ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਦੇ ਤਾਜ਼ੇ ਜੰਮੇ ਹੋਏ ਨਮੂਨਿਆਂ ਦਾ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਜੀਨੋਮਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਟਿਊਮਰਾਂ ਦੀ ਆਰਐਨਏ ਕ੍ਰਮ ਅਤੇ ਮੇਲ ਖਾਂਦੇ ਸਿਹਤਮੰਦ ਕੋਲੋਰੇਕਟਲ ਟਿਸ਼ੂ, ਪੂਰੇ ਐਕਸੋਮ ਕ੍ਰਮ, ਡੂੰਘੇ ਟੀ-ਸੈੱਲ ਰੀਸੈਪਟਰ ਅਤੇ 16S ਬੈਕਟੀਰੀਅਲ ਆਰਆਰਐਨਏ ਜੀਨ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਹੋਰ ਗੁਣਾਂ ਲਈ ਜੀਨੋਮ ਕ੍ਰਮ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ. ਇਹ ਅਧਿਐਨ ਨੇਚਰ ਮੈਡੀਸਨ ਵਿੱਚ "ਇੱਕ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਟਿਊਮਰ, ਇਮਿਊਨ ਅਤੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਐਟਲਸ ਆਫ਼ ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ" ਵਜੋਂ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ।

ਨੇਚਰ ਮੈਡੀਸਨ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ ਲੇਖ

AC-ICAM ਸੰਖੇਪ ਜਾਣਕਾਰੀ

ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੇ ਪ੍ਰਣਾਲੀਗਤ ਥੈਰੇਪੀ ਤੋਂ ਬਿਨਾਂ ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ ਦੇ ਹਿਸਟੋਲੋਜੀਕਲ ਨਿਦਾਨ ਵਾਲੇ ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਤੋਂ ਤਾਜ਼ੇ ਜੰਮੇ ਟਿਊਮਰ ਦੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਅਤੇ ਮੇਲ ਖਾਂਦੇ ਤੰਦਰੁਸਤ ਕੋਲਨ ਟਿਸ਼ੂ (ਟਿਊਮਰ-ਆਮ ਜੋੜੇ) ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਆਰਥੋਗੋਨਲ ਜੀਨੋਮਿਕ ਪਲੇਟਫਾਰਮ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ। ਹੋਲ-ਐਕਸੋਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (WES), RNA-seq ਡਾਟਾ ਗੁਣਵੱਤਾ ਨਿਯੰਤਰਣ, ਅਤੇ ਸੰਮਿਲਨ ਮਾਪਦੰਡ ਸਕ੍ਰੀਨਿੰਗ ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ, 348 ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਦੇ ਜੀਨੋਮਿਕ ਡੇਟਾ ਨੂੰ ਬਰਕਰਾਰ ਰੱਖਿਆ ਗਿਆ ਸੀ ਅਤੇ 4.6 ਸਾਲਾਂ ਦੇ ਮੱਧਮਾਨ ਫਾਲੋ-ਅਪ ਦੇ ਨਾਲ ਡਾਊਨਸਟ੍ਰੀਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਖੋਜ ਟੀਮ ਨੇ ਇਸ ਸਰੋਤ ਨੂੰ Sidra-LUMC AC-ICAM: ਇਮਿਊਨ-ਕੈਂਸਰ-ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਪਰਸਪਰ ਪ੍ਰਭਾਵ ਲਈ ਇੱਕ ਨਕਸ਼ਾ ਅਤੇ ਗਾਈਡ (ਚਿੱਤਰ 1) ਦਾ ਨਾਮ ਦਿੱਤਾ।

ICR ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਅਣੂ ਵਰਗੀਕਰਣ

ਲਗਾਤਾਰ ਕੈਂਸਰ ਇਮਿਊਨੋਸਰਵੇਲੈਂਸ ਲਈ ਇਮਿਊਨ ਜੈਨੇਟਿਕ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਇੱਕ ਮਾਡਿਊਲਰ ਸੈੱਟ ਨੂੰ ਕੈਪਚਰ ਕਰਨਾ, ਜਿਸਨੂੰ ਇਮਿਊਨ ਕੰਸਟੈਂਟ ਆਫ਼ ਰਿਜੈਕਸ਼ਨ (ICR) ਕਿਹਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਖੋਜ ਟੀਮ ਨੇ ICR ਨੂੰ ਇੱਕ 20-ਜੀਨ ਪੈਨਲ ਵਿੱਚ ਸੰਘਣਾ ਕਰਕੇ ਅਨੁਕੂਲ ਬਣਾਇਆ ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਕੈਂਸਰ ਕਿਸਮਾਂ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਮੇਲਾਨੋਮਾ, ਬਲੈਡਰ ਕੈਂਸਰ ਅਤੇ ਛਾਤੀ ਦਾ ਕੈਂਸਰ. ICR ਨੂੰ ਛਾਤੀ ਦੇ ਕੈਂਸਰ ਸਮੇਤ ਕਈ ਕਿਸਮਾਂ ਦੇ ਕੈਂਸਰਾਂ ਵਿੱਚ ਇਮਯੂਨੋਥੈਰੇਪੀ ਪ੍ਰਤੀਕਿਰਿਆ ਨਾਲ ਵੀ ਜੋੜਿਆ ਗਿਆ ਹੈ।

ਸਭ ਤੋਂ ਪਹਿਲਾਂ, ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੇ AC-ICAM ਸਮੂਹ ਦੇ ICR ਦਸਤਖਤ ਨੂੰ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕੀਤਾ, ਇੱਕ ICR ਜੀਨ-ਅਧਾਰਤ ਸਹਿ-ਵਰਗੀਕਰਨ ਪਹੁੰਚ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ, ਸਮੂਹ ਨੂੰ ਤਿੰਨ ਸਮੂਹਾਂ/ਇਮਿਊਨ ਉਪ-ਕਿਸਮਾਂ ਵਿੱਚ ਸ਼੍ਰੇਣੀਬੱਧ ਕਰਨ ਲਈ: ਉੱਚ ICR (ਗਰਮ ਟਿਊਮਰ), ਮੱਧਮ ICR ਅਤੇ ਘੱਟ ICR (ਠੰਡੇ ਟਿਊਮਰ) (ਚਿੱਤਰ 1ਬੀ)। ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੇ ਸਹਿਮਤੀ ਅਣੂ ਉਪ-ਕਿਸਮਾਂ (ਸੀਐਮਐਸ) ਨਾਲ ਸੰਬੰਧਿਤ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧਕ ਪ੍ਰਵਿਰਤੀ ਦੀ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਕੀਤੀ, ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ ਦਾ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ-ਅਧਾਰਿਤ ਵਰਗੀਕਰਨ। CMS ਸ਼੍ਰੇਣੀਆਂ ਵਿੱਚ CMS1/immune, CMS2/canonical, CMS3/metabolic ਅਤੇ CMS4/mesenchymal ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ। ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੇ ਦਿਖਾਇਆ ਕਿ ICR ਸਕੋਰ ਸਾਰੇ CMS ਉਪ-ਕਿਸਮਾਂ ਵਿੱਚ ਕੁਝ ਖਾਸ ਕੈਂਸਰ ਸੈੱਲ ਮਾਰਗਾਂ ਨਾਲ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਬੰਧਿਤ ਸਨ, ਅਤੇ ਇਮਯੂਨੋਸਪਰੈਸਿਵ ਅਤੇ ਸਟ੍ਰੋਮਲ-ਸਬੰਧਤ ਮਾਰਗਾਂ ਨਾਲ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਸਬੰਧ ਸਿਰਫ CMS4 ਟਿਊਮਰਾਂ ਵਿੱਚ ਦੇਖੇ ਗਏ ਸਨ।

ਸਾਰੇ CMS ਵਿੱਚ, ਕੁਦਰਤੀ ਕਾਤਲ (NK) ਸੈੱਲ ਅਤੇ ਟੀ ​​ਸੈੱਲ ਸਬਸੈੱਟਾਂ ਦੀ ਭਰਪੂਰਤਾ ICR ਉੱਚ ਪ੍ਰਤੀਰੋਧਕ ਉਪ-ਕਿਸਮਾਂ ਵਿੱਚ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਸੀ, ਦੂਜੇ ਲਿਊਕੋਸਾਈਟ ਸਬਸੈੱਟਾਂ (ਚਿੱਤਰ 1c) ਵਿੱਚ ਵਧੇਰੇ ਪਰਿਵਰਤਨਸ਼ੀਲਤਾ ਦੇ ਨਾਲ। ICR ਇਮਿਊਨ ਉਪ-ਕਿਸਮਾਂ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਪ੍ਰਗਤੀਸ਼ੀਲ ਵਾਧੇ ਦੇ ਨਾਲ, ਵੱਖ-ਵੱਖ OS ਅਤੇ PFS ਸਨ। ICR ਵਿੱਚ ਨੀਵੇਂ ਤੋਂ ਉੱਚੇ (ਚਿੱਤਰ 1d), ਵਿੱਚ ICR ਦੀ ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ ਸੰਬੰਧੀ ਭੂਮਿਕਾ ਨੂੰ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕਰਨਾ ਕੋਲੋਰੈਕਟਲ ਕੈਂਸਰ.

ਚਿੱਤਰ 1. AC-ICAM ਅਧਿਐਨ ਡਿਜ਼ਾਈਨ, ਇਮਿਊਨ-ਸਬੰਧਤ ਜੀਨ ਹਸਤਾਖਰ, ਇਮਿਊਨ ਅਤੇ ਅਣੂ ਉਪ-ਕਿਸਮਾਂ ਅਤੇ ਬਚਾਅ।
ICR ਟਿਊਮਰ-ਅਨੁਕੂਲ, ਕਲੋਨਲੀ ਐਂਪਲੀਫਾਈਡ ਟੀ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਕੈਪਚਰ ਕਰਦਾ ਹੈ
ਟਿਊਮਰ ਟਿਸ਼ੂ ਵਿੱਚ ਘੁਸਪੈਠ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਟੀ ਸੈੱਲਾਂ ਦੀ ਇੱਕ ਘੱਟ ਗਿਣਤੀ ਨੂੰ ਟਿਊਮਰ ਐਂਟੀਜੇਨਜ਼ (10% ਤੋਂ ਘੱਟ) ਲਈ ਖਾਸ ਦੱਸਿਆ ਗਿਆ ਹੈ। ਇਸ ਲਈ, ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਇੰਟਰਾ-ਟਿਊਮਰ ਟੀ ਸੈੱਲਾਂ ਨੂੰ ਬਾਈਸਟੈਂਡਰ ਟੀ ਸੈੱਲ (ਬਾਈਸਟੈਂਡਰ ਟੀ ਸੈੱਲ) ਕਿਹਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਉਤਪਾਦਕ ਟੀਸੀਆਰ ਦੇ ਨਾਲ ਪਰੰਪਰਾਗਤ ਟੀ ਸੈੱਲਾਂ ਦੀ ਸੰਖਿਆ ਦੇ ਨਾਲ ਸਭ ਤੋਂ ਮਜ਼ਬੂਤ ​​​​ਸੰਬੰਧ ਸਟ੍ਰੋਮਲ ਸੈੱਲ ਅਤੇ ਲਿਊਕੋਸਾਈਟ ਉਪ-ਜਨਸੰਖਿਆ (ਆਰਐਨਏ-ਸੀਕ ਦੁਆਰਾ ਖੋਜਿਆ ਗਿਆ) ਵਿੱਚ ਦੇਖਿਆ ਗਿਆ ਸੀ, ਜੋ ਕਿ ਟੀ ਸੈੱਲ ਉਪ-ਜਨਸੰਖਿਆ (ਚਿੱਤਰ 2a) ਦਾ ਅੰਦਾਜ਼ਾ ਲਗਾਉਣ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ। ICR ਕਲੱਸਟਰਾਂ (ਸਮੁੱਚੀ ਅਤੇ CMS ਵਰਗੀਕਰਣ) ਵਿੱਚ, ICR-ਹਾਈ ਅਤੇ CMS ਉਪ-ਕਿਸਮ CMS1/ਇਮਿਊਨ ਗਰੁੱਪਾਂ (ਚਿੱਤਰ 2c) ਵਿੱਚ ਇਮਿਊਨ SEQ TCRs ਦੀ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਕਲੋਨੈਲਿਟੀ ਆਈਸੀਆਰ-ਹਾਈ ਟਿਊਮਰ ਦੇ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਅਨੁਪਾਤ ਦੇ ਨਾਲ ਦੇਖੀ ਗਈ ਸੀ। ਪੂਰੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ (18,270 ਜੀਨਾਂ) ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ, ਛੇ ICR ਜੀਨ (IFNG, STAT1, IRF1, CCL5, GZMA, ਅਤੇ CXCL10) TCR ਇਮਿਊਨ SEQ ਕਲੋਨੈਲਿਟੀ (ਚਿੱਤਰ 2d) ਨਾਲ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਜੁੜੇ ਚੋਟੀ ਦੇ ਦਸ ਜੀਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਸਨ। ਟਿਊਮਰ-ਜਵਾਬਦੇਹ CD8+ ਮਾਰਕਰ (ਚਿੱਤਰ 2f ਅਤੇ 2g) ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਦੇਖੇ ਗਏ ਸਬੰਧਾਂ ਨਾਲੋਂ ਇਮਯੂਨੋਐਸਈਕਿਊ ਟੀਸੀਆਰ ਕਲੋਨੈਲਿਟੀ ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਆਈਸੀਆਰ ਜੀਨਾਂ ਨਾਲ ਵਧੇਰੇ ਮਜ਼ਬੂਤੀ ਨਾਲ ਸਬੰਧਿਤ ਹੈ। ਸਿੱਟੇ ਵਜੋਂ, ਉਪਰੋਕਤ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸੁਝਾਅ ਦਿੰਦਾ ਹੈ ਕਿ ਆਈਸੀਆਰ ਦਸਤਖਤ ਟਿਊਮਰ-ਅਨੁਕੂਲਿਤ, ਕਲੋਨਲੀ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਧੇ ਹੋਏ ਟੀ ਸੈੱਲਾਂ ਦੀ ਮੌਜੂਦਗੀ ਨੂੰ ਕੈਪਚਰ ਕਰਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਇਸਦੇ ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ ਸੰਬੰਧੀ ਪ੍ਰਭਾਵਾਂ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹੈ।

ਚਿੱਤਰ 2. ਟੀਸੀਆਰ ਮੈਟ੍ਰਿਕਸ ਅਤੇ ਇਮਿਊਨ-ਸਬੰਧਤ ਜੀਨਾਂ, ਇਮਿਊਨ ਅਤੇ ਅਣੂ ਉਪ-ਕਿਸਮਾਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧ।
ਸਿਹਤਮੰਦ ਅਤੇ ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ ਦੇ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਵਿੱਚ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਰਚਨਾ
ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੇ 246 ਮਰੀਜ਼ਾਂ (ਚਿੱਤਰ 3a) ਤੋਂ ਮੇਲ ਖਾਂਦੀਆਂ ਟਿਊਮਰ ਅਤੇ ਸਿਹਤਮੰਦ ਕੋਲਨ ਟਿਸ਼ੂ ਤੋਂ ਕੱਢੇ ਗਏ ਡੀਐਨਏ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ 16S rRNA ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਕੀਤਾ। ਪ੍ਰਮਾਣਿਕਤਾ ਲਈ, ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੇ ਵਾਧੂ 42 ਟਿਊਮਰ ਨਮੂਨਿਆਂ ਤੋਂ 16S rRNA ਜੀਨ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਡੇਟਾ ਦਾ ਵੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੀਤਾ ਜੋ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਉਪਲਬਧ ਆਮ ਡੀਐਨਏ ਨਾਲ ਮੇਲ ਨਹੀਂ ਖਾਂਦੇ ਸਨ। ਪਹਿਲਾਂ, ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੇ ਮੇਲ ਖਾਂਦੀਆਂ ਟਿਊਮਰਾਂ ਅਤੇ ਸਿਹਤਮੰਦ ਕੋਲਨ ਟਿਸ਼ੂ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਬਨਸਪਤੀ ਦੀ ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਭਰਪੂਰਤਾ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਕੀਤੀ। ਸਿਹਤਮੰਦ ਨਮੂਨੇ (ਚਿੱਤਰ 3a-3d) ਦੇ ਮੁਕਾਬਲੇ ਟਿਊਮਰਾਂ ਵਿੱਚ ਕਲੋਸਟ੍ਰਿਡੀਅਮ ਪਰਫ੍ਰਿੰਜੈਂਸ ਕਾਫ਼ੀ ਵਾਧਾ ਹੋਇਆ ਸੀ। ਟਿਊਮਰ ਅਤੇ ਸਿਹਤਮੰਦ ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿਚਕਾਰ ਅਲਫ਼ਾ ਵਿਭਿੰਨਤਾ (ਇੱਕ ਨਮੂਨੇ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਦੀ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਅਤੇ ਭਰਪੂਰਤਾ) ਵਿੱਚ ਕੋਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਅੰਤਰ ਨਹੀਂ ਸੀ, ਅਤੇ ਆਈਸੀਆਰ-ਲੋਅ ਟਿਊਮਰਾਂ ਦੇ ਮੁਕਾਬਲੇ ਆਈਸੀਆਰ-ਉੱਚ ਟਿਊਮਰਾਂ ਵਿੱਚ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਮਾਮੂਲੀ ਕਮੀ ਦੇਖੀ ਗਈ ਸੀ।
ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਾਂ ਅਤੇ ਕਲੀਨਿਕਲ ਨਤੀਜਿਆਂ ਵਿਚਕਾਰ ਡਾਕਟਰੀ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸੰਬੰਧਿਤ ਸਬੰਧਾਂ ਦਾ ਪਤਾ ਲਗਾਉਣ ਲਈ, ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਦਾ ਉਦੇਸ਼ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਲਈ 16S rRNA ਜੀਨ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਡੇਟਾ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਨਾ ਹੈ ਜੋ ਬਚਾਅ ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਕਰਦੇ ਹਨ। AC-ICAM246 'ਤੇ, ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੇ ਇੱਕ OS Cox ਰਿਗਰੈਸ਼ਨ ਮਾਡਲ ਚਲਾਇਆ ਜਿਸ ਨੇ ਗੈਰ-ਜ਼ੀਰੋ ਗੁਣਾਂ (ਅੰਤਰਾਲ ਮੌਤ ਦਰ ਦੇ ਜੋਖਮ ਨਾਲ ਸੰਬੰਧਿਤ) ਦੇ ਨਾਲ 41 ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਦੀ ਚੋਣ ਕੀਤੀ, ਜਿਸਨੂੰ MBR ਕਲਾਸੀਫਾਇਰ (ਚਿੱਤਰ 3f) ਕਿਹਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
ਇਸ ਸਿਖਲਾਈ ਸਮੂਹ (ICAM246) ਵਿੱਚ, ਇੱਕ ਘੱਟ MBR ਸਕੋਰ (MBR<0, ਘੱਟ MBR) ਮੌਤ ਦੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਘੱਟ ਜੋਖਮ (85%) ਨਾਲ ਜੁੜਿਆ ਹੋਇਆ ਸੀ। ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਨੇ ਦੋ ਸੁਤੰਤਰ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਸਮੂਹਾਂ (ICAM42 ਅਤੇ TCGA-COAD) ਵਿੱਚ ਘੱਟ MBR (ਜੋਖਮ) ਅਤੇ ਲੰਬੇ ਸਮੇਂ ਤੱਕ OS ਵਿਚਕਾਰ ਸਬੰਧ ਦੀ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕੀਤੀ। (ਚਿੱਤਰ 3) ਅਧਿਐਨ ਨੇ ਐਂਡੋਗੈਸਟ੍ਰਿਕ ਕੋਕੀ ਅਤੇ ਐਮਬੀਆਰ ਸਕੋਰ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਇੱਕ ਮਜ਼ਬੂਤ ​​ਸਬੰਧ ਦਿਖਾਇਆ, ਜੋ ਕਿ ਟਿਊਮਰ ਅਤੇ ਸਿਹਤਮੰਦ ਕੋਲਨ ਟਿਸ਼ੂ ਵਿੱਚ ਸਮਾਨ ਸਨ।

ਚਿੱਤਰ 3. ਟਿਊਮਰ ਅਤੇ ਸਿਹਤਮੰਦ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਵਿੱਚ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਅਤੇ ਆਈਸੀਆਰ ਅਤੇ ਮਰੀਜ਼ ਦੇ ਬਚਾਅ ਨਾਲ ਸਬੰਧ।
ਸਿੱਟਾ
ਇਸ ਅਧਿਐਨ ਵਿੱਚ ਵਰਤੀ ਗਈ ਮਲਟੀ-ਓਮਿਕਸ ਪਹੁੰਚ ਕੋਲੋਰੇਕਟਲ ਕੈਂਸਰ ਵਿੱਚ ਇਮਿਊਨ ਪ੍ਰਤੀਕ੍ਰਿਆ ਦੇ ਅਣੂ ਦੇ ਹਸਤਾਖਰ ਦੀ ਪੂਰੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਖੋਜ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਅਤੇ ਇਮਿਊਨ ਸਿਸਟਮ ਵਿਚਕਾਰ ਆਪਸੀ ਤਾਲਮੇਲ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਟਿਊਮਰ ਅਤੇ ਸਿਹਤਮੰਦ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਦੇ ਡੂੰਘੇ ਟੀਸੀਆਰ ਕ੍ਰਮ ਤੋਂ ਪਤਾ ਲੱਗਿਆ ਹੈ ਕਿ ਆਈਸੀਆਰ ਦਾ ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ ਪ੍ਰਭਾਵ ਟਿਊਮਰ-ਅਨੁਕੂਲਿਤ ਅਤੇ ਸੰਭਵ ਤੌਰ 'ਤੇ ਟਿਊਮਰ ਐਂਟੀਜੇਨ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਟੀ ਸੈੱਲ ਕਲੋਨਾਂ ਨੂੰ ਹਾਸਲ ਕਰਨ ਦੀ ਸਮਰੱਥਾ ਦੇ ਕਾਰਨ ਹੋ ਸਕਦਾ ਹੈ।

AC-ICAM ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ 16S rRNA ਜੀਨ ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਟਿਊਮਰ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਰਚਨਾ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਕੇ, ਟੀਮ ਨੇ ਮਜ਼ਬੂਤ ​​ਪੂਰਵ-ਅਨੁਮਾਨ ਦੇ ਮੁੱਲ ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਹਸਤਾਖਰ (MBR ਜੋਖਮ ਸਕੋਰ) ਦੀ ਪਛਾਣ ਕੀਤੀ। ਹਾਲਾਂਕਿ ਇਹ ਦਸਤਖਤ ਟਿਊਮਰ ਦੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਤੋਂ ਲਿਆ ਗਿਆ ਸੀ, ਪਰ ਸਿਹਤਮੰਦ ਕੋਲੋਰੈਕਟਮ ਅਤੇ ਟਿਊਮਰ MBR ਜੋਖਮ ਸਕੋਰ ਵਿਚਕਾਰ ਇੱਕ ਮਜ਼ਬੂਤ ​​ਸਬੰਧ ਸੀ, ਜੋ ਸੁਝਾਅ ਦਿੰਦਾ ਹੈ ਕਿ ਇਹ ਦਸਤਖਤ ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਦੇ ਅੰਤੜੀਆਂ ਦੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਰਚਨਾ ਨੂੰ ਹਾਸਲ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹੈ। ICR ਅਤੇ MBR ਸਕੋਰਾਂ ਨੂੰ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਇੱਕ ਬਹੁ-ਓਮਿਕ ਵਿਦਿਆਰਥੀ ਬਾਇਓਮਾਰਕਰ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨਾ ਅਤੇ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕਰਨਾ ਸੰਭਵ ਸੀ ਜੋ ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ ਵਾਲੇ ਮਰੀਜ਼ਾਂ ਵਿੱਚ ਬਚਾਅ ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਅਧਿਐਨ ਦਾ ਮਲਟੀ-ਓਮਿਕ ਡੇਟਾਸੈਟ ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ ਬਾਇਓਲੋਜੀ ਨੂੰ ਬਿਹਤਰ ਤਰੀਕੇ ਨਾਲ ਸਮਝਣ ਅਤੇ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਇਲਾਜ ਸੰਬੰਧੀ ਪਹੁੰਚ ਖੋਜਣ ਵਿੱਚ ਮਦਦ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਸਰੋਤ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।

ਹਵਾਲਾ:
Roelands, J., Kuppen, PJK, ਅਹਿਮਦ, EI et al. ਕੋਲਨ ਕੈਂਸਰ ਦਾ ਇੱਕ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਟਿਊਮਰ, ਇਮਿਊਨ ਅਤੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਐਟਲਸ। ਨੈਟ ਮੇਡ 29, 1273–1286 (2023)।